Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SGCGQ13326 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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SGCGQ13326 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SGCGQ13326 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SGCGQ13326 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SGCGQ13326 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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SGCGQ13326 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SGCGQ13326 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SGCGQ13326 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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