Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms