Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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ERCC8Q13216 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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ERCC8Q13216 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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ERCC8Q13216 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
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ERCC8Q13216 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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ERCC8Q13216 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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ERCC8Q13216 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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ERCC8Q13216 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ERCC8Q13216 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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