Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHAF1BQ13112 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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