Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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IFT88Q13099 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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IFT88Q13099 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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IFT88Q13099 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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IFT88Q13099 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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IFT88Q13099 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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IFT88Q13099 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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