Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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