Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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