Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNTN1Q12860 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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