Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
VPREB1P12018 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms