Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRCP08575 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms