Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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SH3BP1Q9Y3L3 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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SH3BP1Q9Y3L3 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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SH3BP1Q9Y3L3 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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SH3BP1Q9Y3L3 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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