Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CGGBP1Q9UFW8 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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