Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COPS7AQ9UBW8 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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