Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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HOXD1Q9GZZ0 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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HOXD1Q9GZZ0 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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HOXD1Q9GZZ0 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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HOXD1Q9GZZ0 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HOXD1Q9GZZ0 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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HOXD1Q9GZZ0 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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HOXD1Q9GZZ0 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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HOXD1Q9GZZ0 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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HOXD1Q9GZZ0 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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