Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SIGMAR1Q99720 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SIGMAR1Q99720 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms