Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SAMD8Q96LT4 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms