Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
BCANQ96GW7 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms