Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGF29Q96ES7 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGF29Q96ES7 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.2 ms