Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TDRD12Q587J7 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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