Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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PTPROQ16827 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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PTPROQ16827 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
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PTPROQ16827 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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PTPROQ16827 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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PTPROQ16827 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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PTPROQ16827 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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PTPROQ16827 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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PTPROQ16827 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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PTPROQ16827 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPROQ16827 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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