Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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ZNF239Q16600 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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