Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL23Q16540 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
MRPL23Q16540 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
MRPL23Q16540 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
MRPL23Q16540 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL23Q16540 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL23Q16540 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL23Q16540 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL23Q16540 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL23Q16540 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms