Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
SSX1Q16384 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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SSX1Q16384 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
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SSX1Q16384 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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SSX1Q16384 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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SSX1Q16384 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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SSX1Q16384 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSX1Q16384 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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