Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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