Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms