Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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PTPRKQ15262 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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PTPRKQ15262 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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PTPRKQ15262 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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PTPRKQ15262 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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PTPRKQ15262 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRKQ15262 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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PTPRKQ15262 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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PTPRKQ15262 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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PTPRKQ15262 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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PTPRKQ15262 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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PTPRKQ15262 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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PTPRKQ15262 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRKQ15262 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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