Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERPUD1Q15011 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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