Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
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