Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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