Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
CAPRIN1Q14444 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CAPRIN1Q14444 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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