Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PKP1Q13835 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PKP1Q13835 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKP1Q13835 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKP1Q13835 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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