Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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APOFQ13790 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
APOFQ13790 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
APOFQ13790 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
APOFQ13790 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
APOFQ13790 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
APOFQ13790 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
APOFQ13790 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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APOFQ13790 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
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