Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms