Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ALCAMQ13740 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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