Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1SQ13698 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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