Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL1Q13616 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL1Q13616 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms