Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HDAC1Q13547 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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