Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRPF4BQ13523 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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PRPF4BQ13523 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRPF4BQ13523 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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