Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ITGB3BPQ13352 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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ITGB3BPQ13352 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
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ITGB3BPQ13352 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
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ITGB3BPQ13352 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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ITGB3BPQ13352 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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ITGB3BPQ13352 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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ITGB3BPQ13352 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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ITGB3BPQ13352 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
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ITGB3BPQ13352 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
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ITGB3BPQ13352 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ITGB3BPQ13352 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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