Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATMQ13315 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATMQ13315 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATMQ13315 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATMQ13315 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
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