Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SKP2Q13309 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SKP2Q13309 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms