Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NME3Q13232 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NME3Q13232 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NME3Q13232 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
NME3Q13232 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
NME3Q13232 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms