Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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