Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHAF1AQ13111 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHAF1AQ13111 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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