Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
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