Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217 ms