Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPFP49454 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPFP49454 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CENPFP49454 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPFP49454 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPFP49454 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPFP49454 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPFP49454 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPFP49454 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPFP49454 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPFP49454 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPFP49454 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPFP49454 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPFP49454 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPFP49454 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPFP49454 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.36□□□□□ -2.63
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CENPFP49454 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPFP49454 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPFP49454 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
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CENPFP49454 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
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CENPFP49454 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPFP49454 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
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CENPFP49454 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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CENPFP49454 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPFP49454 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPFP49454 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPFP49454 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPFP49454 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPFP49454 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPFP49454 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPFP49454 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPFP49454 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPFP49454 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPFP49454 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPFP49454 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPFP49454 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPFP49454 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPFP49454 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPFP49454 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPFP49454 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
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