Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TSPOP30536 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TSPOP30536 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TSPOP30536 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TSPOP30536 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TSPOP30536 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TSPOP30536 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSPOP30536 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TSPOP30536 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSPOP30536 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSPOP30536 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSPOP30536 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSPOP30536 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TSPOP30536 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TSPOP30536 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TSPOP30536 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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