Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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PTPRMP28827 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
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PTPRMP28827 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
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PTPRMP28827 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRMP28827 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRMP28827 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRMP28827 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
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PTPRMP28827 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRMP28827 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRMP28827 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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PTPRMP28827 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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PTPRMP28827 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRMP28827 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
PTPRMP28827 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRMP28827 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0□□□□□ -2.41
PTPRMP28827 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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PTPRMP28827 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPRMP28827 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPRMP28827 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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