Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRDP23468 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
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PTPRDP23468 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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